凡那比颱風遠離，陳菊市長20日天上午5時在災害應變中心第五次工作會議指示市府各機關、軍方單位、公營機構全力進行颱風後的復原工作。陳菊市長並做出以下指示：
一、請工務局與各區公所儘速調集各式抽水機組，協助市民排除地下室積水事形，另為迅速恢復民生供電，請工務局與台電公司合作排定優先順序，各有關局處全力配合。
二、請社會局、交通局、區公所密切配合，積極調配，淹水區域救濟物資務必配送到位，以滿足市民民生需求為第一要務。
三、積水消退後，市區勢必產生許多廢棄物，請環保局、衛生局、民政局、各區公所密切配合，優先處理淹水區域垃圾，落實災後消毒、防疫與登革熱防制措施，並請求軍方派員支援兵力清運大型廢棄物，務必全體總動員，達到滴水不漏的境界。
四、請民政局、區公所要求里幹事以主動積極之精神，宣導協助市民申請淹水救助，並詳細說明補助標準。
五、請觀光局運用媒體宣導本府協助排除地下室積水、大型垃圾清運、申請淹水救助…等災後復原措施。
六、災後復原工作，請環保局與工務局養工處等再辛苦一點，希望能在最短的時間內將環境清掃整潔，將倾倒的樹木扶正，讓市容儘速恢復。
七、各機關務必在最短時間內恢復市容景觀、道路交通、公園設施…等，讓市民生活回歸常軌；如有兵力需求請兵役處協助申請國軍支援。
八、請工務局、民政局及其他局處，視災情狀況運用「天然災害準備金」優先搶救災害。