98年7月4日通車當日上午9時捷運內湖線正式連接木柵線通車營運,當日上午6時至9時捷運木柵線配合停駛,臺北市政府將比照往例於上午6時至下午2時提供「辛亥線」及「軍末u」兩線免費接駁公車接駁民眾。
另因應捷運內湖線通車後,為減輕捷運南港展覽館站與南港站未連通所造成不便之情形,臺北市公共運輸處規劃闢駛「免費換乘公車」銜接捷運南港展覽館站至南港站,以強化此段捷運未連通端之運輸服務。免費換乘公車將於捷運南港線未通達南港展覽館站(預定99年底通車)前,由臺北大眾捷運股份有限公司租用大客車闢駛免費換乘公車路線,該路線往返於捷運南港展覽館站與南港站間,上車地點分別為捷運南港展覽館4號出入口經貿一路側,南港站2號出入口公車彎側,行經路線為忠孝東路、研究院路、經貿一、二路及南港路,為達快速接駁目的,途中不設站停靠,免費搭乘。